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Séquençage NGS (Next Generation Sequencing)

Identification des variants connus (génotypes) ou inconnus (Variants, Recombinants, Virus mosaïques...) des pathogènes animaux

Applications :

  • PRRSV : Investigation moléculaire des "faux négatifs en PCR", mise à jour des tests diagnostics, choix raisonnés des vaccins, ....
  • Coronavirus Porcins : Surveillance de l'émergence en Europe des variants d'origine Américaine ou Asiatique
  • Métagénomique ciblée ou de novo : Détection de tout ou partie des pathogènes présents dans des matrices complexes (lait, avortons, ...)
    • Détection, Génotypage et Sous-génotypage du virus PRRSV par qPCR et Séquençage NGS des ORFs 2, 3, 4, 5, 6, 7 et NSP2
    • Détection et Classification du virus PEDV en fonction de sa virulence et pathogénicité par qPCR et Séquençage NGS du domaine S1

En collaboration avec BioDev (dirigé par Claire Pelletier):

  • Formations en Biologie Moléculaire (selon la norme U 47-600)
  • Designs de PCR
  • Applications HRM
  • Audits des services PCR
  • ...

Séquençage